Avaliação de grandes modelos de linguagem na extração de informações clínica
DOI:
https://doi.org/10.59681/2175-4411.v16.iEspecial.2024.1306Palavras-chave:
Síndrome, Sinais e Sintomas, Processamento de Linguagem NaturalResumo
Objetivo: investigar a eficácia dos modelos de linguagem de grande escala (LLM) no reconhecimento de entidades nomeadas (NER) em notas clínicas em português. Método: Foi analisado o desempenho dos modelos de linguagem GPT-3.5, Gemini, Llama-3 e Sabiá-2, na realização de NER em 30 notas clínicas para identificação das entidades "Sinais ou Sintomas", "Doenças ou Síndromes" e "Dados Negados". A tarefa de NER foi avaliada pelos resultados da precisão, recall e F-score em cada um destes LLMs. Resultados: O modelo Llama-3 apresentou desempenho superior, especialmente em sensibilidade, alcançando um F-score de 0,538. O GPT-3.5 demonstrou desempenho equilibrado, enquanto o Gemini mostrou maior precisão, mas menor sensibilidade. Conclusão: Os resultados indicam que a escolha do modelo depende da ponderação adequada desses fatores em relação aos requisitos individuais de cada aplicação clínica.
Referências
Yadav, P., Steinbach, M., Kumar, V., & Simon, G. (2018). Mining Electronic Health Records (EHRs). ACM Computing Surveys, 50(6), 1–40. doi:10.1145/3127881 DOI: https://doi.org/10.1145/3127881
Jensen, P. B., Jensen, L. J., & Brunak, S. (2012). Mining electronic health records: towards better research applications and clinical care. Nature Reviews Genetics, 13(6), 395–405. doi:10.1038/nrg3208 DOI: https://doi.org/10.1038/nrg3208
Assale, M., Dui, L. G., Cina, A., Seveso, A., & Cabitza, F. (2019). The Revival of the Notes Field: Leveraging the Unstructured Content in Electronic Health Records. Frontiers in Medicine, 6. doi:10.3389/fmed.2019.00066 DOI: https://doi.org/10.3389/fmed.2019.00066
Sun, Peng et al. "An overview of named entity recognition." 2018 International Conference on Asian Language Processing (IALP). IEEE, 2018. p. 273-278. DOI: https://doi.org/10.1109/IALP.2018.8629225
DA SILVA, Diego Pinheiro et al. "Exploring named entity recognition and relation extraction for ontology and medical records integration". Journal of Informatics in Medicine Unlocked vol. 43 (2023): 2352-9148. doi:10.1016/j.imu.2023.101381 DOI: https://doi.org/10.1016/j.imu.2023.101381
Liu, Zhengliang, et al. "Deid-gpt: Zero-shot medical text de-identification by gpt-4." arXiv preprint arXiv:2303.11032 (2023).
Schneider, Elisa Terumi Rubel et al. "BioBERTpt: a portuguese neural language model for clinical Named Entity Recognition." Proceedings of the 3rd Clinical Natural Language Processing Workshop. 19 November 2020, 2020. DOI: https://doi.org/10.18653/v1/2020.clinicalnlp-1.7
Schneider, E. T. R, et al., "CardioBERTpt: Transformer-based Models for Cardiology Language Representation in Portuguese," 2023 IEEE 36th International Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS), L'Aquila, Italy, 2023, pp. 378-381, doi: 10.1109/CBMS58004.2023.00247. DOI: https://doi.org/10.1109/CBMS58004.2023.00247
Oliveira, L.E.S.e., Peters, A.C., da Silva, A.M.P. et al.. SemClinBr - a multi-institutional and multi-specialty semantically annotated corpus for Portuguese clinical NLP tasks. J Biomed Semantics. 2022;13(1):13. Published 2022 May 8. doi:10.1186/s13326-022-00269-1 DOI: https://doi.org/10.1186/s13326-022-00269-1
https://openai.com/index/chatgpt/ [Internet]. San Francisco: OpenAI; c2024 [cited 2024 May 31]. Available from: https://openai.com/index/chatgpt/.
Apresentando o Gemini: nosso maior e mais hábil modelo de IA. [Internet]. California: Google; c2024 [cited 2024 May 31]. Available from: https://blog.google/intl/pt-br/novidades/tecnologia/apresentando-o-gemini-nosso-maior-e-mais-habil-modelo-de-ia/#mensagem-sundar.
https://llama.meta.com/llama3/ [Internet]. California: Meta; c2024 [cited 2024 May 31]. Available from: https://llama.meta.com/llama3/
https://www.maritaca.ai/sabia-2 Internet]. São Paulo: Maritaca AI; c2024 [cited 2024 May 31]. Available from: https://www.maritaca.ai/sabia-2
GE, Yao et al. "Few-shot learning for medical text: A review of advances, trends, and opportunities". Journal of Biomedical Informatics vol. 144 (2023): 1532-0464. doi: 10.1016/ j.jbi.2023.104458 DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbi.2023.104458
Bird, S., Klein, E., & Loper, E. (2009). Natural language processing with Python: analyzing text with the natural language toolkit. " O’Reilly Media, Inc."
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