Una herramienta para contar alelos en nubes computacionales

Autores/as

  • Marcio Nogueira Pereira Silva Universidade do Estado do Rio de Janeiro
  • Luís Cristóvão Pôrto Universidade do Estado do Rio de Janeiro
  • Alexandre da Costa Sena Universidade do Estado do Rio de Janeiro

DOI:

https://doi.org/10.59681/2175-4411.v16.iEspecial.2024.1312

Palabras clave:

Grandes datos, Nubes Computacionales, Alelos HLA

Resumen

Objetivo: desarrollar un marco para realizar comparaciones antropológicas, clasificar alelos, inferir el tiempo de espera de los pacientes que requieren trasplantes, entre otros análisis. Método: comparación de alelos de donantes y pacientes mediante un algoritmo de búsqueda para realizar análisis, basado en recuentos de alelos. Para reducir el tiempo de ejecución de los análisis, se optimizaron y paralelizaron las consultas, permitiendo su ejecución eficiente en las nubes informáticas. Resultados: el framework es capaz de realizar análisis en segundos, incluso en una base de datos que contiene más de 5 millones de registros. Conclusión: el marco propuesto tiene el potencial de ayudar a los médicos/investigadores a obtener información para mejorar el proceso de donación de órganos entre donantes no emparentados.

Biografía del autor/a

Marcio Nogueira Pereira Silva, Universidade do Estado do Rio de Janeiro

PhD student, Institute of Mathematics and Statistics, Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro (RJ), Brasil.

Luís Cristóvão Pôrto, Universidade do Estado do Rio de Janeiro

PhD/Professor, Histocompatibility and Cryopreservation Laboratory, Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro (RJ), Brasil.

Alexandre da Costa Sena, Universidade do Estado do Rio de Janeiro

PhD/Professor, Institute of Mathematics and Statistics, Universidade do Estado do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro (RJ), Brasil.

Citas

Singh AK, McGuirk JP. Allogeneic Stem Cell Transplantation: A Historical and Scientific Overview. Cancer Research (2016) 76:6445-6451.

Tiercy JM. How to select the best available related or unrelated donor of hematopoietic stem cells? Haematologica (2016) 101(6):680-687.

Gragert L. et al. HLA match likelihoods for hematopoietic stem-cell grafts in the U.S. registry. New England Journal of Medicine, 2014, 371(4):339-348.

Burns LJ, Miller JP, Confer DL. Past, present and future of the national marrow donor program. Revista de Hematología. 2016;17(3):195-204.

Dehn J. et al. HapLogic: A predictive human leukocyte antigen matching algorithm to enhance rapid identification of optimal unrelated hematopoietic stem cell sources for transplantation. Biology of Blood and Marrow Transplantation. 2016, 22(11):2038-2046.

Bochtler, W. et al. A Comparative Reference Study for the Validation of HLA-Matching Algorithms in the Search for Allogeneic Hematopoietic Stem Cell donors and cord blood units. HLA. 2016, 87(6).

Marcio N. P. Silva, Karla Figueiredo, Luís C. M. S. Pôrto, Alexandre C. Sena. Uma Abordagem para Análise de Padrões em Banco de Dados de Doadores de Órgãos. Anais do Simpósio Brasileiro de Computação Aplicado a Saúde. 2022.

Lancaster AK, Single RM, et al. PyPop: A mature open-source software pipeline for population genomics. Frontiers in Immunology. 2024, 15.

Excoffier L, Lischer HE. Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Mol Ecol Resour. 2010, 10(3):564-567.

Nunes K, Aguiar V, Silva M. et al. How Ancestry Influences the Chances of Finding Unrelated Donors: An Investigation in Admixed Brazilians. Frontiers in Immunology. 2020, 11.

REDOME - Registro Nacional de Doadores Voluntários de Medula Óssea. 2024.

Publicado

2024-11-19

Cómo citar

Silva, M. N. P., Pôrto, L. C., & Sena, A. da C. (2024). Una herramienta para contar alelos en nubes computacionales. Journal of Health Informatics, 16(Especial). https://doi.org/10.59681/2175-4411.v16.iEspecial.2024.1312

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